على الرغم من فوائد الشاي وعلى الرغم من قلة خطورته مقارنة مع القهوة من حيث نسبة إختلاف الكافيين، إلا أن الشاي يصبح مضرآ في الحالات التالية:
1. إذا تم الإفراط في تناوله: يسبب قرحة في المعدة والاثني عشر.
2. إذا تم غليه كثيرآ بحيث تحول لونه إلى اللون البني الغامق: يسبب إضطراب في عضلة القلب وإمساك وكسل بالجهاز الهضمي.
3. إذا تم شربه بعد الاكل مباشرة: يسبب عسر للهضم، لذلك يفضل شربه بعد ساعة من تناول الأكل.
4. إذا تم شربه على الريق (لمعدة فارغة) أو (أثناء الجوع): يكون طبقة تسمى(كيتينية) على الغشاء الداخلي للمعدة والأمعاء، مما يمنع خروج عصارات الهضم ويسبب إمساكآ وعسر هضم.
5. مرضى حصوات الكلى ومرضى القرحة المعدية أو قرحة الأثني عشر.